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科學警備隊隊員光超一郎從宇宙空間站EGG3前往地球的途中與不明宇宙人遭遇,自稱為"奧特曼"的宇宙人告訴他地球上的各種怪獸與超自然現象危機迫在眉睫,但奧特曼無法以宇宙人的身姿在地球上長期生活,所以便借用光超一郎的身體與之合為一體,並可以用"閃光之星"來隨時變身,使人類得以應付即將到來的各種危機…作為奧特曼系列的動畫版,比起特攝片有固有的優勢。在這裡,主角可以做以前奧特曼們無法完成的特技。同時在一話中可以有數個奧特曼和怪獸登場,而不用額外的開銷。而且,怪獸的設計者們不用再被這個時代"怪獸的皮套需要適應人的體型"這一技術條件所限制。因此,他們的創造力可以無限發揮。