看到搭檔望月芽心被有著玄內樣貌的神秘男人所傷，緬因貓獸再度開始暴走。“不能讓你誕生在世上…”從現實世界消失的緬因貓獸，正是歪曲本身。是擁有過於巨大力量的，毀滅世界的鑰匙——西島大吾以及出現在望月博士之處的黑客獸，逐漸解明真相。保證世界調和的恒常性將現在變得過於強大的緬因貓獸視為危險，而要將其切除。隨著暴走的緬因貓獸的出現，現實世界開始進入毀滅前的倒計時。其所波及的地點接連發生異變。因歪曲而現身的數碼寶貝們，等待著那一時刻的來臨——被選召的孩子們，受到異常的數碼世界排斥，返回現實世界，卻因為與搭檔數碼寶貝在一起而遭到人們的追趕。眾人陷入孤立無援卻仍然拼命地尋求對策，與此同時芽心獨自一人持續煩惱著。同伴和數碼寶貝的聲音，都傳達不到因背負過大的負擔而遭受打擊的她心中…之後，殘酷的命運，甚至逼近了靈魂比任何人都率直纖細的八神光身邊——
