故事發生在德川幕府第二十五代將軍德川慶康統治下的日本,德川家設立了武應學園,並組織了學生會,用以對抗還試圖頑固抵抗的豐臣一派。柳生宗朗(平川大輔 配音)是武應學園的高材生,一天,當他正在道場裡練習時,一位名叫柳生十兵衛(悠木碧 配音)的美少女從天而降,柳生就這樣莫名其妙的多了一個“妹妹”,和十兵衛開始了同居生活。外表年幼實則足智多謀的真田幸村(釘宮理惠 配音)、英姿颯爽大大咧咧的後藤又兵衛(小林優 配音)、優雅的千金大小姐德川千姬(壽美菜子 配音)、風紀委員服部半蔵(後藤沙緒裡 配音),這些姑娘們接二連三的出現在了柳生的身邊。