位於日本某處的偏僻鄉村--霞高原町,通稱“霞之裡”在這裡有一所培養女忍者的養成學校“私立志能備學園”。為了成為傑出女忍者的女孩們從全國聚集而來,每天都在這裡進行著學習和訓練,當然“霞之裡”的人們都是這所學校的畢業生。某天,在這個一成不變的村子裡,有一個女孩和一個男性造訪了這裡。憧憬著女忍的生活,仰慕著“市川電蔵”老師。為了成為女忍而入學“私立志能備學園”來到這裡的普通女孩日向葵。以及為了逃避債主而來到這裡擔當老師的萬里小路隼人。他們兩人的到來是必然還是偶然?充滿歡笑,挫折,悲傷,成長的忍者物語開始了......