1997年,作為聯合國選出的“十大未來領袖”之一的靳鐵生博士(劉德華 飾)正陷入了一場謀殺陰謀,其他幾位未來領袖先後身亡,期間全港通訊出現故障,有人死於人體爆炸……警方迅速展開對靳鐵生的保護,然而靳鐵生仍然沉浸在失去女友Adele(李嘉欣 飾)的痛苦之中,他拒絕了英國MI6部門的保護,要求自己的小學同學——CID焦大鵬(黃秋生 飾)貼身陪伴自己隨著焦大鵬和MI6的調查深入,眾多嫌疑對象被一一排除,然而靳鐵生再次遭遇怪事——死去的Adele送給他一張卡片,卡上正是一位MI6重重保護中的人物的地址,而此人很快消失無蹤。警方侵入某日本網絡系統,獲得了一連串事件背後策劃者的部分信息——他們關註了大量各宗教經典中對於世界末日的描述。這時,Adele再次出現,留給靳、焦兩人前往布拉格機票,在那裡,也許有所有問題的答案…